Poslaním slovenského veľvyslanectva v Chorvátsku je všestranný obojstranne prospešný rozvoj spolupráce medzi Slovenskom a Chorvátskom.
Veľvyslanectvo zastupuje a chráni záujmy Slovenskej republiky a jej občanov, reprezentuje zabezpečuje prezentáciu SR navonok v teritóriu Chorvátska, aktívne sa usiluje o podporu a prehlbovanie bilaterálnych politických, ekonomicko-hospodárskych, kultúrnych a ďalších vzťahov.
Jednou z prioritných úloh veľvyslanectva je aj konzulárno-právna ochrana slovenským občanom a pomoc slovenským občanom SR, ktorí sa na území Chorvátska ocitnú v núdzi.